男生拉尿疼痛是否会自愈，需要根据具体病因来判断，分析如下：
1.生理因素：
憋尿：长时间憋尿后突然排尿，可能会导致膀胱颈部和后尿道受到刺激，引起疼痛。这种情况通常是暂时的，排尿后疼痛会逐渐缓解。
饮水过少：饮水过少会导致尿液浓缩，其中的代谢产物浓度增加，可能会刺激尿道，引起疼痛。增加水分摄入后，尿液稀释，疼痛通常会减轻或消失。
2.炎症：
尿道炎：尿道炎是尿道黏膜的炎症，可导致尿道红肿、疼痛、尿频、尿急等症状。如果炎症较轻，通过适当休息、多饮水，炎症可能会逐渐消退，疼痛也会缓解。但如果炎症严重，可能需要使用抗生素进行治疗。
前列腺炎：前列腺炎是前列腺的炎症，可引起尿频、尿急、尿痛、会阴部疼痛等症状。前列腺炎的治疗需要综合考虑病因、病情严重程度等因素，通常需要使用抗生素、α受体阻滞剂等药物进行治疗，部分患者可能需要手术治疗。自行恢复的可能性较小。
膀胱炎：膀胱炎是膀胱黏膜的炎症，可导致尿频、尿急、尿痛、下腹部疼痛等症状。膀胱炎的治疗方法与尿道炎类似，通常需要使用抗生素进行治疗。
3.结石：
尿道结石：尿道结石可导致排尿困难、尿痛、血尿等症状。较小的结石可能会自行排出体外，疼痛也会随之缓解。但如果结石较大，可能需要进行体外冲击波碎石或手术取石等治疗方法。
膀胱结石：膀胱结石可导致尿频、尿急、尿痛、排尿中断等症状。较小的结石可以通过多饮水、多运动等方法促进排出。如果结石较大，可能需要进行膀胱镜取石或手术治疗。
4.其他：
包茎或包皮过长：包茎或包皮过长时，包皮口狭窄，排尿时尿液通过狭窄的部位会受到刺激，引起疼痛。这种情况可能需要进行包皮环切术等治疗。
尿道损伤：尿道损伤可导致排尿疼痛、血尿等症状。尿道损伤的治疗需要根据损伤的程度进行处理，严重的损伤可能需要手术修复。
需要注意的是，男生拉尿疼痛可能是多种原因引起的，如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如尿频、尿急、尿不尽、发热等，应及时就医，进行相关检查，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，在治疗期间应注意休息，多饮水，避免食用辛辣刺激性食物，保持尿道口清洁。