阴茎根部出现小疙瘩可能是以下情况导致：
一、局部感染：
1.生殖器炎症：阴茎可能出现发红变青、流脓、生痔疮、阴茎口经常性漏水、无法勃起等情况。一般是由于抵抗力低或不洁性接触感染细菌等致病微生物而引起炎症反应。主要表现为瘙痒、尿频等，局部有红肿、疼痛等现象，若是细菌感染的可能性较大。可局部涂抹红霉素软膏或口服左氧氟沙星片、头孢呋辛酯片、阿奇霉素片等进行治疗。
2.毛囊炎：阴茎毛囊炎通常是因脂肪分泌旺盛堵塞毛囊或清洁不及时导致毛囊堵塞炎症。常见为散在性，如米粒大小，鲜红色或深红色毛囊性丘疹，阴毛处会有少许疙瘩。可每天早晚用黄柏洗液外洗，局部涂抹红霉素软膏，并口服广谱抗菌素。同时要注意饮食清淡，不吃海鲜，保持局部卫生清洁，建议每天清洗阴茎并勤换内裤。