扁桃体发炎时，常用的药物有抗生素类和对症治疗药物等。一般来说，细菌感染引起的扁桃体发炎，可选用青霉素类抗生素，如阿莫西林等，一般用药后数天内症状会有改善。
抗生素类药物
青霉素类： 如果是细菌感染导致的扁桃体发炎，青霉素类药物是常用选择，像阿莫西林，它通过抑制细菌细胞壁的合成发挥杀菌作用，对多种引起扁桃体发炎的细菌有效果。不过对青霉素过敏者不能使用。头孢菌素类： 比如头孢拉定，也是针对细菌感染的扁桃体发炎，它能破坏细菌细胞壁达到杀菌目的，抗菌谱较广，不过同样要注意过敏情况，有头孢类药物过敏史的人禁用。
对症治疗药物
解热镇痛药： 当扁桃体发炎伴有发热、咽痛时，可使用对乙酰氨基酚，它能通过抑制前列腺素的合成来起到解热镇痛的作用，成人一般可以服用，但要注意按照推荐剂量使用，过量可能对肝脏有影响。儿童也有适合的剂型，不过剂量要根据体重等计算。还有布洛芬，也能缓解发热和咽痛，它的作用机制是抑制环氧化酶，减少前列腺素合成，从而减轻炎症和疼痛，同样儿童用药需谨慎，要遵医嘱。
局部用药
含漱液： 可以使用复方硼砂含漱液，它有消毒防腐的作用，能清洁口腔，减轻扁桃体发炎引起的咽部不适，每天可以含漱多次，使用时按照说明书操作。含片： 比如度米芬含片，能抑制和杀灭细菌，缓解扁桃体发炎带来的咽痛等症状，含服时要注意按照规定的次数和剂量来用。
特殊人群用药注意
儿童： 儿童扁桃体发炎用药要更加谨慎，抗生素的选择和剂量都要严格遵医嘱，比如青霉素类药物，儿童使用时要根据体重计算合适的剂量，同时要密切观察用药后的反应，如是否有过敏等情况。孕妇： 孕妇扁桃体发炎用药需格外小心，一些抗生素可能会对胎儿产生影响，所以要在医生的指导下选择相对安全的药物，像某些头孢菌素类药物在医生评估后可能会谨慎使用，解热镇痛药的选择也需要医生权衡利弊。