怀孕期间有细菌性阴道炎，可通过如下方式进行治疗：一、补充营养，孕妇应进食优质蛋白质、高维生素、高纤维素、矿物质食物等，如牛肉、大豆、绿豆、牛奶、黄瓜、芹菜、金针菇、小米、玉米等，能为自身及胎儿补充丰富营养，增强体质；二、保持外阴清洁，由于细菌性阴道炎孕妇会有外阴瘙痒、异味、分泌物增多等症状，所以要每日用温水清洁外阴，勤换内裤，保持外阴清洁干燥，降低感染几率；三、局部用药，若孕妇病情较重，可在专业医生指导下使用硝呋太尔片、制霉素阴道栓等药物进行治疗，起到抗炎作用，改善不适症状；四、口服药物，外用药物效果不佳时，可遵医嘱口服抗炎药物，如奥硝唑片、制霉素片等，也可与外用药物联合使用；五、定期检查，治疗期间要注意进行白带常规检查以明确治疗效果，还应进行B超检查以明确胎儿是否有发育异常情况。
除上述常见方式外，如果炎症影响到胎儿发育甚至导致胎儿畸形，则需及时配合医生采取终止妊娠等处理方式，同时要密切观察胎儿情况，避免炎症扩散危及胎儿健康。若出现其他不适症状，建议孕妇及时到医院产科就诊。总之，孕妇患有细菌性阴道炎应根据具体情况选择合适的治疗方法，并密切关注病情变化和胎儿状况。