脑蛋白水解物是一种大脑所特有的肽能神经营养药物，能以多种方式作用于中枢神经，调节和改善神经元的代谢，促进突触的形成，诱导神经元的分化，并进一步保护神经细胞免受各种缺血和神经毒素的损害。
促进大脑发育与修复方面
促进神经细胞发育： 脑蛋白水解物可以为神经细胞的生长、发育提供营养支持，有助于胎儿或婴幼儿大脑神经细胞的正常分化与成熟。例如在胚胎发育过程中，它能参与神经细胞的增殖、迁移等重要过程。修复受损神经： 当脑部受到外伤、缺血缺氧等因素导致神经细胞受损时，脑蛋白水解物能通过激活腺苷酸环化酶，增加脑内ATP的含量，促进蛋白质合成以及影响DNA合成和可提取RNA的含量，从而促进受损神经细胞的修复。比如在脑卒中患者的康复过程中，辅助使用脑蛋白水解物可能有助于神经功能的恢复。
改善认知与精神状态方面
改善认知功能： 它可以影响大脑中与认知相关的神经递质系统等，从而改善患者的认知功能。对于一些因脑部疾病导致认知障碍的患者，如血管性痴呆患者，使用脑蛋白水解物后可能在一定程度上改善其记忆力、注意力等认知指标。调节精神状态： 能够对与情绪、精神相关的神经机制产生作用，有助于改善患者的精神状态。比如在一些神经衰弱患者的治疗中，配合使用脑蛋白水解物可能对缓解患者的焦虑、抑郁情绪有一定帮助，但具体效果因个体差异而异。
在神经系统疾病治疗中的应用方面
用于脑血管疾病： 在脑梗死、脑出血等脑血管疾病的恢复期，脑蛋白水解物可辅助改善脑部的神经代谢，促进受损神经功能的恢复。临床研究发现，在常规治疗基础上加用脑蛋白水解物，能在一定程度上提高患者的神经功能缺损评分的改善率。用于颅脑外伤： 对于颅脑外伤患者，脑蛋白水解物可以通过营养神经、促进神经修复等作用，帮助患者减轻神经功能缺损程度，促进患者的康复。例如在颅脑外伤后的急性期过后，使用脑蛋白水解物辅助治疗，有助于患者神经功能的恢复和生活质量的提高。