细菌性痢疾主要通过使用抗生素来治疗，一般经过规范治疗，多数患者在1~2周内可逐渐康复。
抗生素选择很关键
常用抗生素： 喹诺酮类抗生素如环丙沙星等对细菌性痢疾有较好的疗效，它能抑制细菌DNA旋转酶，阻碍细菌DNA复制，从而发挥杀菌作用。不过，儿童、孕妇及哺乳期女性一般不首选喹诺酮类药物，因为可能会影响骨骼发育等。头孢类抗生素： 像头孢曲松等头孢菌素类药物也是治疗细菌性痢疾的常用药，通过干扰细菌细胞壁的合成来达到杀菌目的，对于不能用喹诺酮类药物的人群较为适用。
一般治疗不能少
休息与饮食： 患者需要充分休息，有助于身体恢复。在饮食方面，要进食易消化、高热量、高维生素的流食或半流食，比如小米粥、软面条等，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，防止加重肠道负担。隔离措施： 细菌性痢疾具有传染性，患者需要进行消化道隔离，防止病菌传播给他人，尤其是在急性期要严格隔离，直到症状消失、大便培养连续2次阴性为止。
对症治疗很重要
补液治疗： 如果患者有脱水情况，需要进行补液。轻度脱水可以口服补液盐来补充水分和电解质，一般成人每小时可口服500~1000毫升；中重度脱水则需要通过静脉补液，快速补充丢失的水分和电解质，纠正水、电解质紊乱和酸碱平衡失调。退热治疗： 对于发热的患者，如果体温超过38.5℃，可以使用物理降温，如用温水擦拭额头、腋窝、腹股沟等部位，也可以在医生指导下使用退热药物，像对乙酰氨基酚等，但要注意儿童用药的剂量和禁忌。