目前室间隔缺损的多数费用大概在5万左右。不过每个地方的实际情况各异，收费标准有所不同，因此会存在一定差别。
一、先心病治疗支持力度较大：现在国家对于先心病治疗的支持力度比较高，很多地方的农合医保都能报销很大一部分，而且还有部分基金会给予支持，使得先心病孩子手术费用的负担日益减小。
二、特殊情况费用会增高：有部分孩子病情严重，比如合并心衰、肺炎，或是低年龄、低体重，亦或是合并其他畸形手术，这样手术费用往往会更高。如果孩子手术后心功能恢复不佳，或者出现其他特殊并发症，也通常会增加手术费用，但这种情况毕竟只是极少数。
三、手术负担明显减轻：室间隔缺损的手术负担如今已显著减轻，大多数家庭都能够承受。对于部分较为贫困或困难的家庭，往往也能够找到一些基金会，或者政府的相关项目来获得资助。
总之，室间隔缺损手术费用整体处于可承受范围，且有多种途径减轻家庭负担。