女生肚脐正中间里面疼可能由以下原因引起：
1.脐炎：脐部凹陷处极易积水、积污，且不易干燥，加上此处温度适宜，是细菌良好的培养基。脐炎轻者表现为局部有脓性分泌物，有臭味；重者炎症扩散形成腹壁感染，甚至败血症。
2.寄生虫感染：以蛔虫感染多见，除了肚脐周围疼痛外，还可能伴有食欲不振、营养不良、睡眠不安等症状。
3.肠痉挛：这是一种胃肠道疾病，主要表现为阵发性的腹痛，脐周部位为主，每次持续时间不等，可自行缓解。肠痉挛的发生与饮食、肠道气体积聚等因素有关。
4.肠梗阻：肠道内容物不能正常运行或通过发生障碍时，称为肠梗阻。其主要表现为腹痛、呕吐、停止排气排便等，脐周部位也会出现疼痛。
5.腹部受凉：腹部受凉后，胃肠道平滑肌会痉挛，引起疼痛。
6.其他：如胃溃疡、十二指肠溃疡、阑尾炎等疾病，也可能导致肚脐正中间里面疼。
如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如发热、恶心、呕吐、腹泻等，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。