舌苔发黑舌根起小泡可能是以下原因导致：
1.饮食因素：食用了某些食物或药物，如黑芝麻、桑葚、抗生素等，可能导致舌苔发黑。此外，辛辣、刺激性食物也可能刺激口腔黏膜，导致舌根起小泡。
2.口腔卫生不良：不注意口腔清洁，食物残渣、细菌等在口腔内滋生，可能引起舌苔发黑、舌根起小泡等症状。
3.感染：病毒、细菌等感染口腔黏膜，可能导致炎症反应，出现舌苔发黑、舌根起小泡等症状。
4.维生素缺乏：维生素B2、B12等缺乏，可能导致口腔黏膜炎症，出现舌苔发黑、舌根起小泡等症状。
5.其他：内分泌失调、免疫系统问题等也可能导致舌苔发黑、舌根起小泡等症状。
针对舌苔发黑舌根起小泡的问题，可以采取以下措施：
1.保持口腔清洁：早晚刷牙，饭后漱口，使用牙线、漱口水等辅助清洁工具。
2.调整饮食：避免食用辛辣、刺激性食物，多吃新鲜的蔬菜、水果，补充维生素。
3.治疗原发病：如果舌苔发黑舌根起小泡是由于感染、维生素缺乏等原因引起的，需要积极治疗原发病。
4.就医检查：如果舌苔发黑舌根起小泡持续不愈或伴有其他症状，如疼痛、肿胀、口臭等，建议及时就医，进行口腔检查、血常规等检查，以明确病因，并进行针对性治疗。
需要注意的是，以上内容仅供参考，如果症状持续不缓解或加重，建议及时就医，在医生的指导下进行治疗。