不一定。巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病变，可引起痛经、性交痛、月经异常等症状。CA125是一种肿瘤标志物，在巧克力囊肿患者中可能会升高，但不是所有巧克力囊肿患者的CA125指标都会升高。
巧克力囊肿患者的CA125升高的原因可能与以下因素有关：
囊肿破裂：巧克力囊肿可能会自发破裂，囊液流入腹腔，刺激腹膜，导致炎症反应和CA125升高。
痛经：巧克力囊肿患者常伴有痛经，痛经可能导致腹腔内炎症和细胞因子释放，从而引起CA125升高。
其他因素：巧克力囊肿还可能与免疫功能异常、内分泌紊乱等因素有关，这些因素也可能导致CA125升高。
需要注意的是，CA125升高并不一定意味着患有癌症，其他疾病也可能导致CA125升高。此外，CA125指标的升高程度也不能单独作为诊断巧克力囊肿的依据，还需要结合临床症状、B超、腹腔镜等检查结果进行综合判断。
对于巧克力囊肿患者，如果出现CA125升高，医生可能会进一步评估病情，包括进行其他检查、观察症状变化等。如果CA125升高程度较轻，且无明显症状，可能会定期复查，以监测病情变化。如果CA125升高明显或伴有明显症状，可能需要进行治疗，治疗方法包括药物治疗、手术治疗等。
总之，巧克力囊肿患者的CA125指标是否升高以及升高的程度需要综合考虑多种因素，医生会根据具体情况进行评估和治疗。患者应遵医嘱进行检查和治疗，并定期复查，以了解病情变化。