皮脂腺囊肿治疗主要以手术切除为主，一旦确诊，通常建议在无感染时尽早手术切除，完整摘除囊肿，复发几率较低。比如体表较小的皮脂腺囊肿，手术一般比较简单，花费相对也不高。
手术治疗
小囊肿切除： 如果皮脂腺囊肿较小，医生会在局部麻醉下进行切除，手术切口选择在囊肿表面，沿皮纹方向做梭形切口，将囊肿完整摘除。术后恢复相对较快，一般7 - 10天左右拆线。较大囊肿切除： 对于较大的皮脂腺囊肿，手术时需要做较大的切口，完整剥离囊肿。术后可能需要更长时间恢复，要注意保持切口清洁，防止感染。
继发感染时的处理
抗感染治疗： 当皮脂腺囊肿继发感染出现红肿、疼痛等症状时，首先需要进行抗感染治疗，可以口服抗生素，如头孢类抗生素，一般根据感染情况口服3 - 7天左右，以控制炎症。切开引流： 如果囊肿感染形成脓肿，需要切开引流，将脓液排出，定期换药，待炎症控制后再考虑择期手术切除囊肿，避免再次复发。
日常注意事项
保持皮肤清洁： 平时要注意保持皮肤清洁，尤其是皮脂腺丰富的部位，如面部、背部等，每天用温水清洗，减少皮脂腺分泌物堆积，降低皮脂腺囊肿发生的几率。避免挤压： 千万不要自行挤压皮脂腺囊肿，因为挤压可能会导致囊肿感染扩散，加重病情，还可能引起更严重的感染并发症。