新生儿呼吸困难的原因包括呼吸系统疾病、循环系统疾病和中枢神经系统疾病。以下分别进行详细说明：
一、呼吸系统疾病：这是导致新生儿呼吸困难较为常见的一类疾病。
1.气道病变：如气管狭窄、声带麻痹、咽部囊肿、血管瘤等情况，都会致使通气不畅，从而引发呼吸困难现象。
2.肺部问题：像肺透明膜病、新生儿肺炎、肺出血、肺不张等肺部疾病，均能导致通气不顺畅以及换气障碍，进而出现不同程度的缺氧和呼吸困难等症状。
二、循环系统疾病：若新生儿患有复杂先天性心脏病或后天性心脏病，以及持续性肺动脉高压等状况，都有可能导致呼吸衰竭，进而表现为呼吸困难等情形。
三、中枢神经系统疾病：新生儿出生时若发生窒息导致缺氧缺血性脑病，或者出现颅内出血、感染等情况，引起脑水肿、颅内压增高，会抑制呼吸中枢，造成新生儿呼吸困难。
在喂养新生儿时，需特别注意避免呛奶现象。因为新生儿胃容量较小，如果喂养奶量过多或喂完奶后未进行拍嗝，就容易引起呛奶，可能会误吸入肺而导致新生儿肺炎。建议家长在喂奶时应避免过急或过快，喂完奶后要适当拍嗝，避免立即平躺以防止呛咳发生。
总之，新生儿呼吸困难可能由多种原因引起，要及时就医明确病因，不可延误病情。同时，喂养方面也要多加注意，减少不良情况的发生。