射精时小肚子疼可能与以下原因有关：
1.前列腺炎或精囊炎：这两种疾病可能导致射精时前列腺和精囊收缩，从而引起小肚子疼痛。此外，还可能伴有尿频、尿急、尿痛、血精等症状。
2.精索静脉曲张：精索静脉曲张可能导致精索内静脉回流受阻，使蔓状静脉丛扩张、迂曲和变长。在射精时，精索会收缩，可能加重精索静脉曲张，引起小肚子疼痛。
3.其他原因：射精时小肚子疼痛还可能与其他因素有关，如性生活过于频繁、动作过于剧烈、泌尿系统感染、结石等。
如果出现射精时小肚子疼的情况，建议及时就医，进行相关检查，如前列腺液检查、精索静脉超声、泌尿系统超声等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。此外，在日常生活中，应注意保持良好的生活习惯，避免过度劳累、长时间久坐、憋尿等。