卵巢囊肿的症状因囊肿的性质、大小等不同而有所差异。大部分卵巢囊肿早期可能没有明显症状，常在妇科检查时偶然发现。但当囊肿较大或发生一些特殊情况时，会出现相应表现。
腹部不适症状
下腹部坠胀感： 较大的卵巢囊肿可能会使患者感到下腹部有坠胀不适的感觉，就好像肚子里有东西往下坠一样。比如囊肿直径超过5厘米时，这种坠胀感可能会比较明显。腹部隐痛： 有些患者会出现腹部隐隐作痛的情况，疼痛程度一般较轻，容易被忽视。如果囊肿发生扭转等情况，疼痛会突然加剧，变为剧烈腹痛。
月经方面的症状
月经周期改变： 卵巢囊肿可能会影响内分泌功能，从而导致月经周期发生变化。有的女性原本月经很规律，但患病后可能出现月经提前或推迟的情况。比如原本28天左右的月经周期，可能变为25天或32天。月经量异常： 部分患者会出现月经量增多或减少的情况。如果是内分泌相关的囊肿，可能会对子宫内膜产生影响，进而导致月经量改变。
压迫相关症状
压迫膀胱出现尿频： 当卵巢囊肿较大时，可能会压迫到膀胱，导致患者出现尿频的症状，总是有想排尿的感觉，但每次尿量不多。尤其是囊肿位于盆腔前部时，这种压迫膀胱引起尿频的情况更常见。压迫直肠引起便秘： 若囊肿向盆腔后部发展，可能会压迫直肠，使患者出现便秘的症状，感觉排便困难。
其他特殊症状
囊肿扭转或破裂时的急性症状： 当卵巢囊肿发生扭转时，患者会突然出现一侧下腹部剧烈疼痛，同时可能伴有恶心、呕吐等症状。如果囊肿破裂，会引起剧烈腹痛，还可能导致腹腔内出血，严重时会出现休克等表现。内分泌紊乱相关症状： 某些具有内分泌功能的卵巢囊肿，比如卵巢睾丸母细胞瘤，可能会导致患者出现男性化表现，像多毛、声音变粗等，或者出现雌激素过多相关症状，如不规则阴道流血等。