男性尿液发黄且异味重可能患有以下疾病：
1.泌尿系统感染：如尿道炎、膀胱炎、前列腺炎等，由于炎症刺激，导致尿液中胆红素、尿胆原等物质含量增加，从而出现尿液发黄、异味重的情况。此外，还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。治疗方法包括使用抗生素（如左氧氟沙星、头孢呋辛酯等）进行抗感染治疗。
2.肝脏疾病：如肝炎、肝硬化等，由于肝脏功能受损，胆红素代谢异常，导致血液中的胆红素水平升高，进而通过尿液排出，出现尿液发黄的现象。同时，还可能伴有皮肤发黄、乏力、食欲不振等症状。治疗方法主要是针对肝脏疾病进行治疗，如使用抗病毒药物（如恩替卡韦、替诺福韦酯等）治疗肝炎，使用保肝药物（如还原型谷胱甘肽、多烯磷脂酰胆碱等）治疗肝硬化。
3.其他疾病：如溶血性疾病、泌尿系统结石等，也可能导致尿液发黄且异味重。溶血性疾病可能导致胆红素升高，泌尿系统结石可能引起尿液中细菌繁殖，从而出现异味。
需要注意的是，以上只是一些可能的疾病，具体情况需要结合患者的症状、体征、实验室检查等综合判断。如果出现尿液发黄且异味重的情况，建议及时就医，进行相关检查，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意个人卫生，多喝水，避免憋尿，少吃辛辣刺激性食物。