怀孕50天时通过医学检查不能查出男孩女孩。因为在怀孕50天时，胎儿的外生殖器还没有完全发育，通过B超等检查方法也难以准确判断胎儿的性别。
通常在怀孕4个月左右，胎儿的外生殖器已经可以通过B超等检查方法分辨，但在我国非医学需要的胎儿性别鉴定是违法行为，因此医生不会在医学检查中告知或透露胎儿的性别。
需要注意的是，性别鉴定不应该是关注的重点，而胎儿的健康才是最重要的。在孕期，孕妇应该注意保持良好的生活习惯，如均衡饮食、适量运动、保持心情愉悦等，以保障胎儿的健康发育。同时，定期进行产前检查，及时发现和处理任何异常情况，也是保障母婴健康的重要措施。