孕晚期扁桃体发炎对胎儿的影响视情况而定，若病情较轻通常不会影响胎儿，但若病情严重则可能有影响，应尽早就医控制炎症。
一、不会影响：
扁桃体发炎可能由细菌或病毒感染引发。在孕晚期，胎儿已基本成熟，此时出现扁桃体发炎，若积极治疗一般不会对胎儿造成不良影响。扁桃体发炎会导致喉咙疼痛、发热等症状。治疗上，可使用蓝芩口服液、蒲地蓝消炎口服液等药物，若为细菌感染可给予抗生素如头孢克洛片、阿莫西林片等进行抗感染治疗，通常3至5天可恢复正常。
二、有影响：
孕晚期扁桃体发炎若未受重视，病情严重导致持续性发热，可能引发早产、胎盘早剥等危害。
总之，孕期扁桃体发炎应及时就医，在医生指导下尽早治疗，以免耽误病情。