肺脓肿治疗主要包括抗感染治疗、脓液引流等。一般来说，经过规范治疗，大部分患者可逐渐康复。
抗感染治疗
经验性用药：初始治疗常根据病情经验选用抗生素，如青霉素类药物，对大多数常见致病菌有一定抗菌作用。对于厌氧菌感染为主的肺脓肿，常用克林霉素等药物，能较好覆盖厌氧菌。针对性用药：可根据痰培养及药敏试验结果调整抗生素。若痰培养提示金黄色葡萄球菌感染，可能需要选用耐酶青霉素类或头孢菌素类药物等。
脓液引流
体位引流：根据脓肿部位采取适当体位，如病变在肺上部，可采取坐位或半坐位引流，每天进行2 - 3次，每次15 - 20分钟，通过重力作用使脓液排出。例如，肺上叶后段脓肿，可采取前倾坐位引流。机械引流：对于痰液黏稠不易排出的患者，可采用纤维支气管镜吸引脓液，有助于清除堵塞气道的脓液，促进炎症吸收。
支持治疗
营养支持：患者需要摄入充足的热量、蛋白质和维生素等营养物质，以增强机体抵抗力，一般建议每日热量摄入在2000千卡以上，保证优质蛋白质如瘦肉、鱼类、蛋类等的摄入。对症治疗：对于发热患者，可根据体温情况进行退热治疗，体温超过38.5℃时，可选用对乙酰氨基酚等退热药物；对于咳嗽咳痰明显的患者，可适当使用止咳祛痰药物，如氨溴索等，帮助缓解症状，但要注意在脓液引流的基础上使用，避免单纯镇咳导致脓液引流不畅。
手术治疗
手术指征：经过积极抗感染和引流治疗无效的慢性肺脓肿，如病程超过3个月，仍有厚壁脓腔，反复感染、咯血等情况时，可考虑手术治疗。一般来说，符合手术指征的患者约占10% - 20%左右。手术方式：常用的手术方式有肺叶切除术等，通过切除病变肺组织来达到治疗目的，但手术有一定风险，需要严格评估患者的身体状况等。