眼结膜结石是可以治疗的。一般来说，当眼结膜结石没有引起明显不适时，可先观察；若出现眼部异物感等不适症状，则需要进行处理。
观察等待情况
如果眼结膜结石较小，没有突出于结膜表面，也没有引起眼部明显的异物感等不适症状，通常可以选择观察等待。此时不需要进行特殊的治疗，但要注意保持眼部的清洁卫生，避免用手过度揉眼，定期观察结石的变化情况。比如可以每隔1 - 2周用干净的棉签轻轻擦拭眼部周围，观察结石是否有增大或突出的迹象。
局部麻醉下剔除
当眼结膜结石突出于结膜表面，引起明显的眼部异物感、摩擦感等不适时，需要在表面麻醉下将其剔除。首先会用含有表面麻醉剂的眼药水进行眼部麻醉，然后使用消毒的针头或尖刀将结石剔除。这个过程一般比较迅速，在正规的眼科诊所或医院眼科都可以进行。术后需要使用抗生素眼药水预防感染，如氧氟沙星滴眼液等，一般术后1 - 2天眼部的不适症状就会明显缓解。不过，术后要注意避免眼部进水，防止感染加重。
针对病因治疗
眼结膜结石的形成往往与慢性结膜炎等眼部炎症有关，所以在治疗眼结膜结石的同时，还需要针对病因进行治疗。如果是由慢性结膜炎引起的，需要根据结膜炎的类型选择合适的药物进行治疗。例如，细菌性结膜炎可以使用妥布霉素滴眼液等抗生素类眼药水；病毒性结膜炎则需要使用阿昔洛韦滴眼液等抗病毒药物。一般经过对病因的治疗，可以减少眼结膜结石的复发。在治疗病因期间，要按照医生的嘱咐规律用药，并且定期复查眼部情况，根据病情变化调整治疗方案。