灰指甲治疗常用的药物有外用抗真菌药和口服抗真菌药。一般来说，外用药物如阿莫罗芬搽剂等，使用时需坚持较长时间，可能需要数月；口服药物如伊曲康唑等，通常需要按疗程服用，一般一个疗程可能需要数周时间。
外用抗真菌药
阿莫罗芬搽剂： 它是局部外用的抗真菌药物，通过抑制真菌细胞膜的合成来发挥作用。使用时，要先清洁病甲，然后将搽剂均匀涂抹在病甲及周围皮肤上，每周使用1 - 2次，一般需要连续使用数月才能看到较好效果。不过，对于严重的灰指甲，单纯外用可能效果有限。环吡酮胺乳膏： 也属于外用抗真菌药，能渗透进入真菌细胞，影响其细胞器和DNA的合成，从而起到抗菌作用。使用时涂抹在病甲部位，每天1 - 2次，但同样，治疗周期相对较长，需要耐心使用。
口服抗真菌药
伊曲康唑： 是一种口服的广谱抗真菌药，它可以干扰真菌细胞色素P450的活性，抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，达到抗真菌的目的。一般采用冲击疗法，即连续服用一周，停药三周为一个疗程，通常需要2 - 3个疗程。不过，服用伊曲康唑前需要检查肝功能，因为它可能会对肝脏有一定影响，有肝脏疾病的患者要谨慎使用。特比萘芬： 也是口服抗真菌药，能特异性地抑制真菌角鲨烯环氧化酶，阻碍真菌细胞膜成分角鲨烯的代谢，导致真菌细胞膜形成障碍而死亡。它的服用方法相对简单，一般是每天一次，连续服用数周，但同样需要关注肝功能情况，孕妇和哺乳期女性要避免使用。
治疗中的注意事项
在治疗灰指甲时，要注意保持足部或手部的清洁干燥，因为潮湿的环境有利于真菌生长繁殖。比如，要勤换袜子，鞋子也要经常晾晒通风。另外，如果同时有其他部位的真菌感染，如脚气等，要一并治疗，否则容易交叉感染，导致灰指甲反复不好。而且，治疗过程中要按照医嘱定期复诊，医生会根据治疗效果调整治疗方案。对于儿童患者，口服抗真菌药要特别谨慎，因为儿童的肝肾功能还未发育完全，需要在医生严格评估后，权衡利弊再决定是否使用以及选择合适的药物。