怀孕六周B超看不到孕囊，可能是以下原因导致的：
1.怀孕时间较短：孕囊可能还没有发育到可以通过B超看到的大小。建议复查B超，以确定孕囊的位置和发育情况。
2.宫外孕：受精卵可能没有在子宫内着床，而是在输卵管、卵巢等部位着床。这种情况需要及时就医，进行进一步的检查和治疗，以避免宫外孕破裂导致大出血等危险情况。
3.孕囊发育异常：孕囊可能存在发育不良、畸形等问题。需要结合其他检查结果（如血HCG、孕酮等）综合判断。
4.其他因素：子宫内膜过薄、子宫肌瘤、卵巢囊肿等也可能影响孕囊的显示。
如果怀孕六周B超看不到孕囊，建议及时就医，进行详细的检查和咨询。医生会根据具体情况制定相应的处理方案。在等待检查结果和进一步治疗期间，孕妇应注意休息，避免剧烈运动和性生活。同时，要保持良好的心态，积极配合医生的治疗。如果出现阴道流血、腹痛等异常情况，应立即就医。