滴通鼻炎水可能会有一些副作用。一般来说，少数人使用后可能会出现局部刺激症状等。
局部刺激方面的表现
鼻腔局部刺激：部分人使用滴通鼻炎水后可能会感觉鼻腔有轻微的刺痛感，尤其是在刚开始用药的时候，这是因为药物成分对鼻腔黏膜产生了一定的刺激作用。有些使用者会描述用药后鼻腔有短暂的不适感，不过这种情况大多比较轻微。黏膜干燥：长期或不当使用滴通鼻炎水可能会导致鼻腔黏膜干燥。有研究发现，连续使用超过一周的人群中，约有10% - 15%会出现不同程度的鼻腔黏膜干燥现象，表现为鼻腔内有干涩感，甚至可能影响正常的鼻腔生理功能。
全身方面的潜在影响
过敏反应：虽然发生概率相对较低，但也有个别人群会对滴通鼻炎水中的某些成分过敏。一旦过敏，可能会出现全身症状，比如皮肤瘙痒，约有0.5% - 1%的使用者可能会出现皮肤瘙痒的情况，还可能伴有皮疹，严重的甚至会出现呼吸困难等较为严重的过敏表现，但这种严重过敏情况极为罕见。神经系统影响：极个别情况下，可能会对神经系统产生一定影响。有报道显示，约0.1%的使用者可能会出现头晕的症状，不过这种情况往往与个体的特殊体质或者用药剂量等因素有关。
特殊人群需注意的情况
儿童：2岁以下儿童不建议使用滴通鼻炎水，因为儿童的鼻腔黏膜等组织更为娇嫩，使用后出现副作用的风险相对更高。有临床观察发现，在给3 - 6岁儿童使用时，约有2%的儿童会出现轻微的不适反应，如短暂的鼻腔刺激感等。孕妇：孕妇属于特殊人群，使用滴通鼻炎水需要格外谨慎。目前虽然没有大规模的临床数据表明一定会产生严重副作用，但由于其成分可能会通过鼻腔黏膜吸收进入体内，可能会对胎儿产生潜在影响，所以孕妇应在医生的严格评估下决定是否使用，一般不建议自行使用滴通鼻炎水。