怀孕初期上厕所时出现褐色血迹可能是以下原因导致：
1.先兆流产：在怀孕初期，胚胎着床时可能会引起轻微的出血，导致褐色分泌物。此外，孕妇的身体可能会对孕激素不适应，从而引发宫缩，导致流产。除了褐色血迹外，还可能伴有腹部疼痛、腰部酸痛等症状。如果出现大量出血、剧烈腹痛等异常情况，应立即就医。
2.异位妊娠：受精卵在子宫以外的部位着床，如输卵管、卵巢等，也会导致怀孕初期出现褐色血迹。异位妊娠可能会引起腹腔内出血，甚至危及生命。如果伴有剧烈腹痛、恶心、呕吐等症状，应及时就医。
3.宫颈疾病：孕妇患有宫颈息肉、宫颈糜烂等宫颈疾病时，也可能在怀孕初期出现褐色血迹。此外，宫颈癌也可能导致怀孕后阴道出血。如果是宫颈疾病引起的出血，通常在同房后或妇科检查后出现。如果是宫颈癌引起的出血，可能会伴有阴道分泌物异常、恶臭等症状。
4.其他原因：孕妇过度劳累、孕酮水平低、子宫内膜异位症等也可能导致怀孕初期出现褐色血迹。
如果在怀孕初期上厕所时发现褐色血迹，建议及时就医，进行相关检查，如血β-HCG检测、孕酮检测、B超检查等，以确定出血的原因，并采取相应的治疗措施。同时，孕妇应注意休息，避免剧烈运动和性生活，保持心情愉悦，按照医生的建议进行产前检查。