月经干净两天又出血可能由内分泌紊乱、药物因素、妇科疾病等引起。
一、内分泌紊乱：若经常熬夜、频繁饮酒吸烟、精神心理压力过大等，都可能引发内分泌紊乱，进而影响月经周期，导致月经淋漓不尽、周期不稳定等情况，于是会出现月经干净两天后又出血现象。比如长期熬夜会打乱人体的生物钟，影响激素的正常分泌；过度饮酒吸烟会对身体造成不良刺激，干扰内分泌系统的平衡；而过大的精神心理压力会促使体内激素水平失衡。
二、药物因素：女性服用紧急避孕药后，可能会导致撤退性出血，从而在非月经期出现阴道出血，通常这种情况能够自行缓解。这是因为紧急避孕药含有大量孕激素，会使子宫内膜出现异常变化而引起出血。
三、妇科疾病：像宫颈炎、宫颈癌、子宫内膜癌等，当病变加重时，会频繁有阴道出血的表现，还常伴有下腹疼痛、分泌物增多、分泌物异味等症状。例如宫颈炎患者，炎症刺激会使宫颈组织变得脆弱易出血；宫颈癌患者，癌组织本身容易发生破溃出血；子宫内膜癌患者，子宫内膜的异常增生和病变会导致不规则出血。
月经干净两天又出血，且出血量过多并伴有其他不适时，建议及时前往医院妇科进行相应检查和治疗。
总之，月经干净后又出血的原因较为复杂，需要根据具体情况进行综合分析和判断，以便采取合适的治疗措施。