肛门和阴囊连接处里面起了个硬疙瘩，可能是由皮脂腺囊肿、脂肪瘤、肛周脓肿等原因导致。具体如下：
一、皮脂腺囊肿：这主要是由于毛囊皮脂腺口被阻塞，使得皮脂腺过度淤积而形成的囊肿。其可在全身多处出现，如头、背、臀等部位，在局部皮内会有与皮肤紧密粘连的囊肿，且可能伴有轻微疼痛。对于体积较小的皮脂腺囊肿，可经小切口直接切除；体积较大的，则需通过外科手术进行切除。
1.较小的处理方式：经小切口直接切除。
2.较大的处理方式：通过外科手术切除。
二、脂肪瘤：其引起原因尚不完全明确，可能与遗传因素有关，是由成熟脂肪细胞构成的良性肿瘤，能位于身体任何有脂肪的部位，像四肢、躯干、会阴部等，肿瘤可处于皮肤深层或皮下。如果没有任何症状，一般无需处理，定期观察即可；但若引起疼痛，则可通过脂肪瘤切除术进行治疗。
1.无症状的处理：定期观察。
2.有症状的处理：进行脂肪瘤切除术。
三、肛周脓肿：若平时不注重肛门卫生，导致肛门与阴囊连接处长时间受到分泌物刺激，就容易增加细菌入侵几率，诱发炎性硬疙瘩，同时伴有渗出、疼痛等症状，严重时还会引发肛瘘、脓毒症等。建议及时前往医院肛肠科就诊，给予切开引流术以防止进一步感染，之后可在医生指导下口服阿莫西林颗粒、头孢克肟胶囊等药物进行抗炎治疗。
1.就诊科室：肛肠科。
2.治疗方法：切开引流术，配合抗炎药物治疗。
总之，当发现肛门和阴囊连接处有硬疙瘩时，应及时就医明确原因，并根据具体情况采取相应的治疗措施。