囊肿型痤疮是比较严重的一种痤疮类型，治疗方法多样。一般来说，可通过外用药物、口服药物以及物理治疗等方式来改善，通常需要综合治疗，且疗程可能需要数周甚至数月。
外用药物治疗
过氧化苯甲酰： 它可以缓慢释放出新生态氧和苯甲酸，具有杀灭痤疮丙酸杆菌、抗炎的作用。可涂抹在患处，能减轻囊肿型痤疮的炎症反应，不过少数人使用后可能会有皮肤刺激症状，如轻度的红斑、脱屑等。抗生素类药膏： 像克林霉素凝胶，能抑制痤疮丙酸杆菌的生长，对囊肿型痤疮的炎症部位有一定的消炎效果。但要注意，长期使用可能会导致细菌产生耐药性，所以不建议自行长期大面积使用。
口服药物治疗
抗生素： 比如四环素类的米诺环素，能抑制痤疮丙酸杆菌的活性，减轻炎症反应。不过，孕妇、8岁以下儿童要避免使用，而且使用过程中可能会出现胃肠道不适等副作用。异维A酸： 这是针对严重痤疮的有效药物，它可以减少皮脂腺分泌，抑制皮脂腺导管角化，从而改善囊肿型痤疮。但异维A酸有较多禁忌，孕妇绝对禁用，因为它会导致胎儿畸形，而且服用期间要严格避孕，还可能会引起皮肤干燥、口唇干裂等副作用，需要在医生的严密监测下使用。
物理治疗
光动力治疗： 是将光敏剂外用后，通过特定波长的光照射，产生单线态氧等活性氧物质，破坏痤疮丙酸杆菌，减轻炎症反应。一般需要多次治疗，每次治疗间隔一定时间，治疗后局部皮肤可能会有轻度的红肿、结痂等情况，但多数会逐渐恢复。激光治疗： 例如红蓝光治疗，蓝光可以杀灭痤疮丙酸杆菌，红光可以促进皮肤修复。红蓝光治疗通常每周进行2 - 3次，一个疗程可能需要10 - 15次左右，它相对比较安全，副作用较小，能改善囊肿型痤疮的炎症和皮损情况。