肚脐眼发臭可能由以下因素引起：不注意卫生、脐炎、脐尿管囊肿。
一、不注意卫生：这是肚脐眼发臭的常见原因之一。部分人的肚脐眼较深，若平时对其清洁卫生重视不足，就容易使污垢在此堆积。在经常出汗以及衣物遮蔽等情况下，随着时间推移，这些污垢会发生腐败等现象，进而产生臭味。所以，肚脐眼发臭可能是因平时不注意卫生所致。
二、脐炎：当肚脐周围皮肤不慎被指甲刮伤后，若未及时处理伤口，就容易引发局部感染。此时会表现为肚脐流脓水、红肿等症状，同时伴有臭味。因此，肚脐眼发臭可能是脐炎造成的。
三、脐尿管囊肿：其主要与脐尿管先天退化不全有关，属于先天性畸形。当继发感染时，可出现局部炎症反应，也会伴有肚脐眼发臭等情况。故而，肚脐眼发臭可能是脐尿管囊肿导致的。
总之，如果出现肚脐眼发臭的症状且长时间不能缓解，同时还伴有其他不适，建议及时就医，遵循医嘱进行治疗，以免延误最佳治疗时机。