1.外用药物：可选用维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏等药物涂抹疣体，具有一定的治疗效果，但需要坚持使用一段时间。
2.物理治疗：包括冷冻治疗、激光治疗、电灼治疗等，适用于疣体数量较少、面积较小的患者。这些方法可以直接去除疣体，但可能会留下疤痕。
3.口服药物：对于疣体数量较多、病情较严重的患者，可口服抗病毒药物，如利巴韦林、阿昔洛韦等，以抑制病毒复制，促进疣体消退。
4.免疫调节剂：可使用卡介菌多糖核酸、干扰素等免疫调节剂，调节机体免疫力，增强抗病毒能力。
5.中医治疗：中医认为扁平疣是由气血失和、腠理不密、外感风热毒邪所致，可采用中药内服、外用或针灸等方法进行治疗。
需要注意的是，扁平疣的治疗方法应根据患者的具体情况选择，疣体较多或病情较重的患者可联合多种方法治疗。同时，患者在治疗期间应避免搔抓疣体，以免导致自身接种；注意个人卫生，避免与他人共用毛巾、脸盆等物品；保持皮肤清洁，避免感染。