附睾炎的治疗药物需根据病原体等情况选择，一般常用抗生素治疗。比如细菌感染引起的附睾炎，常用的有喹诺酮类如左氧氟沙星等，头孢类如头孢克肟等。一般疗程可能需要1-2周左右。
抗生素类药物选择
喹诺酮类抗生素：左氧氟沙星是常用的喹诺酮类药物，对引起附睾炎的常见致病菌有较好的抗菌作用。它能抑制细菌DNA旋转酶，阻碍细菌DNA复制，从而发挥杀菌作用。头孢类抗生素：头孢克肟属于头孢菌素类抗生素，通过抑制细菌细胞壁的合成来杀菌。对多种革兰阳性菌和革兰阴性菌有抗菌活性，可用于敏感菌导致的附睾炎治疗。
不同病原体对应的药物
细菌感染为主：如果是大肠埃希菌等细菌引起的附睾炎，上述的喹诺酮类或头孢类抗生素较为常用。但如果是耐药菌感染，可能需要根据药敏试验调整用药。衣原体或支原体感染：对于由衣原体或支原体引起的附睾炎，常用药物有阿奇霉素。阿奇霉素能与细菌核糖体50S亚基结合，抑制细菌蛋白质合成，一般疗程需要服用数天。
特殊人群用药注意
儿童患者：儿童患附睾炎相对较少见，若发生，用药需谨慎。一般会选择对儿童相对安全的抗生素，如头孢类药物，但要根据儿童体重等调整剂量，且需密切观察药物不良反应。孕妇及哺乳期妇女：孕妇或哺乳期妇女患附睾炎用药需特别慎重。喹诺酮类药物可能影响儿童软骨发育，孕妇和哺乳期妇女一般不选用；头孢类药物相对较安全，但也需在医生评估下使用，医生会权衡利弊选择合适的药物。