扁桃体炎的治疗药物需根据病情来选，一般细菌感染引起的扁桃体炎常用抗生素，比如青霉素类的抗生素，像阿莫西林，不过对青霉素过敏的人就得换用头孢类等其他抗生素。一般来说，及时用对合适的抗生素，能在几天内缓解症状。
细菌感染引发的扁桃体炎用药
青霉素类： 阿莫西林是常用的青霉素类药物，它能抑制细菌细胞壁合成，起到杀菌作用，对敏感菌引发的扁桃体炎有效。不过对青霉素过敏者不能用。头孢类抗生素： 若对青霉素过敏，可选用头孢克洛等头孢类药物，这类药抗菌谱较广，能针对多种致病菌发挥作用，但也得注意是否有头孢类药物过敏史。
病毒感染引发的扁桃体炎用药
抗病毒药物： 若明确是病毒感染引起的扁桃体炎，像疱疹性咽峡炎由肠道病毒引起，一般没有特效抗病毒药物，主要是对症治疗。但有些情况下可能会用到干扰素等，但应用相对受限。对症药物： 比如有发热症状时，可使用对乙酰氨基酚来退热，缓解不适，它能通过抑制前列腺素合成发挥解热镇痛作用，儿童也能使用合适剂型。
扁桃体炎的局部用药
含漱液： 可以用复方硼砂含漱液，它能清洁口腔、杀菌消炎，减轻扁桃体炎引起的局部炎症反应，每次含漱几分钟，每天多次使用。含片： 比如度米芬含片，含服后能直接作用于咽部黏膜，起到抑菌、消炎的作用，缓解扁桃体炎带来的咽痛等不适。
特殊人群用药注意
儿童： 儿童患扁桃体炎用药需谨慎，比如抗生素的选择要考虑儿童的年龄、体重等，像阿莫西林儿童剂型就有合适的剂量，不过一定要在医生指导下根据儿童具体情况选用，避免自行乱用药。孕妇： 孕妇患扁桃体炎用药更得小心，有些抗生素可能会对胎儿有影响，必须咨询医生，选择相对安全的药物来治疗，不能自行随意用药。