婴儿拉肚子的原因有多种。比如感染因素，其中病毒感染较为常见，像轮状病毒就很容易导致婴儿腹泻，在秋冬季是高发期，约占婴儿秋季腹泻的80%左右；细菌感染也是原因之一，如大肠杆菌等细菌感染肠道后，会引起肠道炎症，导致婴儿拉肚子。
喂养不当导致
喂食过多或过少：如果给婴儿喂食的量没有把握好，喂得过多，婴儿的胃肠道无法完全消化吸收，就容易引起腹泻；而喂食过少，婴儿处于饥饿状态，也可能会出现胃肠功能紊乱，引发拉肚子。食物不合适：给婴儿添加新的辅食时，如果引入的速度过快，婴儿的肠道不能及时适应新食物，也会导致腹泻。比如原本一直吃母乳的婴儿，突然添加了新的配方奶粉，就可能因为不适应而拉肚子。
腹部着凉引发
气温变化影响：当婴儿腹部受到寒冷刺激时，比如夜间睡眠时踢开了被子，腹部暴露在冷空气中，就会引起胃肠道蠕动加快，从而出现拉肚子的情况。保暖措施不当：在给婴儿穿衣服时，如果没有注意腹部的保暖，尤其是在天气较凉的时候，腹部受凉后也容易导致腹泻。
过敏因素导致
食物过敏：有些婴儿可能对牛奶蛋白过敏，当食用了含有牛奶蛋白的奶粉或相关辅食后，就会出现过敏反应，其中腹泻是常见的症状之一。接触过敏物质：婴儿接触到某些过敏物质，虽然不是直接吃进去的，但也可能通过皮肤等途径引起过敏，进而导致胃肠道功能紊乱，出现拉肚子现象。比如接触了新的毛绒玩具等可能引起过敏的物品。