肛周脓肿的危害取决于病情发展程度。一旦明确诊断肛周脓肿，必须立刻进行手术治疗，要是手术不及时或者未做手术，可能引发以下几方面并发症：
一、肛瘘
1.肛周脓肿自行破溃或者进行切开引流后，常常会形成肛瘘。肛瘘的表现为反复感染、肿胀、疼痛、破溃以及流脓。
2.肛瘘一旦形成，自行愈合的机会非常渺茫，还会带来诸多危害，像肛门疼痛、肛门瘙痒、肛周湿疹等。肛瘘的瘘口和瘘管可能会增多，进而形成复杂性肛瘘，给治疗增加难度，并且会对肛门的生理功能产生影响。
二、腹膜炎甚至全身脓毒血症
1.肛周脓肿的感染灶可能向深部间隙扩散，形成较大范围的脓肿，脓液能够从皮下延伸到坐骨直肠窝，从患侧通过组织间隙扩散到对侧，还能经内外括约肌之间向上穿破肛提肌，进入盆腔引发腹膜炎，甚至出现全身脓毒症。
2.病情严重者可能导致休克，甚至会危及生命。
三、癌变危险
长期未得到治疗或错误治疗的慢性肛瘘，存在癌变的可能。
总结概况提示：肛周脓肿危害较大，不及时手术可能引发多种严重并发症，包括肛瘘、腹膜炎、全身脓毒血症以及癌变危险等，必须予以重视并及时正确处理。