皮脂腺异位症的病因目前尚不十分明确，可能与以下因素有关。首先，局部刺激可能是一个因素，比如长期的机械摩擦、创伤等，有研究发现部分患者发病前有局部受到刺激的情况。
生理发育因素
皮脂腺发育异常： 皮脂腺异位症可能是皮脂腺发育的生理性变异和/或皮脂腺增生所致。在胚胎发育过程中，皮脂腺的发育出现异常情况，就可能导致皮脂腺异位症的发生。例如，在某些个体的皮肤黏膜部位，皮脂腺的分布、结构等出现与正常情况不同的改变，进而表现为皮脂腺异位症。内分泌因素： 体内内分泌的变化也可能对皮脂腺异位症的发生有影响。比如，雄激素水平的变化可能会影响皮脂腺的功能和发育。青春期时，雄激素水平升高，皮脂腺功能活跃，部分人可能因为内分泌的波动出现皮脂腺异位症相关表现。
局部刺激相关因素
摩擦刺激： 长期的摩擦刺激是常见的局部刺激因素之一。像一些从事特殊职业的人群，手部经常受到摩擦，或者口腔内牙齿对黏膜的摩擦等，都可能导致局部皮脂腺出现异位增生。例如，长期用牙齿咬颊部黏膜的人，颊部黏膜部位就有可能出现皮脂腺异位症。化学刺激： 局部接触一些化学物质也可能引发皮脂腺异位症。比如长期接触某些刺激性的化妆品、洗浴用品等，这些化学物质可能会对皮肤黏膜的皮脂腺产生刺激，导致皮脂腺异位。例如，长期使用含有刺激性化学成分的洗发水，虽然主要影响头皮，但也可能通过身体的整体代谢等因素间接影响其他部位皮脂腺的状态。
遗传因素推测
遗传倾向： 有研究推测皮脂腺异位症可能存在一定的遗传倾向。如果家族中有亲属患有皮脂腺异位症，那么个体发生该病的风险可能会相对较高。不过目前关于遗传方面的具体机制还不是完全清晰，还需要更多的研究来证实遗传因素在其中的具体作用方式。比如，某些基因的突变或遗传多态性可能与皮脂腺异位症的发生相关，但具体的基因位点等还在进一步探索中。