吃辣椒后肚子疼可能由以下原因引起：
1.辣椒素刺激：辣椒中含有辣椒素，摄入过多可能刺激胃肠道，引起胃肠道痉挛或炎症，导致肚子疼。
2.胃肠功能紊乱：本身存在胃肠功能紊乱、消化不良等问题的人，吃辣椒后可能加重症状，引起肚子疼。
3.胃溃疡、胃炎等疾病：患有胃溃疡、胃炎等疾病的人，吃辣椒可能刺激胃酸分泌，加重病情，导致肚子疼。
4.过敏反应：对辣椒或其中某些成分过敏的人，食用后可能出现过敏反应，包括肚子疼、腹泻等症状。
5.食物搭配不当：如果在吃辣椒的同时还吃了其他不易消化或刺激性的食物，可能加重胃肠道负担，引起肚子疼。
如果吃辣椒后肚子疼的症状持续不缓解或伴有其他不适，如恶心、呕吐、腹泻、发热等，建议及时就医，以便明确病因并进行相应的治疗。同时，为了减轻胃肠道的刺激，建议适量食用辣椒，并注意饮食的均衡和健康。如果本身有胃肠道疾病，应尽量避免或少吃辣椒等刺激性食物。