内分泌检查的最佳检查时间因检查项目而异。一般来说，基础性激素六项检查建议在月经来潮的第2-5天进行，这时候属于卵泡早期，可以反映卵巢的基础功能。
性激素六项检查时间
月经周期第2 - 5天： 此时测定性激素六项能较好地反映卵巢的基础状态，比如可以了解卵泡刺激素（FSH）、黄体生成素（LH）、雌二醇（E2）等基础水平，对于评估多囊卵巢综合征、卵巢功能减退等问题有重要意义。通常建议在早上9 - 11点之间抽血，因为这个时间段激素水平相对稳定。排卵期检查： 如果是想了解排卵情况，比如监测是否有排卵，可在预计的排卵期左右进行检查。一般下次月经前14天左右为排卵期，可通过超声监测卵泡发育情况来确定具体抽血时间，此时主要看孕激素水平等，能判断卵泡是否成熟并排卵。
甲状腺功能检查时间
任意时间均可： 甲状腺功能检查中的促甲状腺激素（TSH）、甲状腺素（T4）、三碘甲状腺原氨酸（T3）等指标一般不受进食影响，所以可以在任意时间抽血检查。不过如果同时还需要检查其他可能受进食影响的项目，最好空腹。比如单纯查甲状腺功能，随时去医院都能检查。但如果正在服用影响甲状腺功能的药物，最好告知医生，因为药物可能会对检查结果产生影响。
血糖相关检查时间
空腹血糖检查： 一般要求空腹8 - 12小时后抽血，通常是在早上进行。比如前一天晚上10点后不再进食，第二天早上7 - 9点之间抽血检测空腹血糖，这样能准确反映基础血糖水平，对于诊断糖尿病等血糖相关疾病很重要。餐后血糖检查： 如果是要检查餐后血糖，一般是从吃第一口饭开始计时，2小时后抽血。比如诊断糖尿病时，常需要检测空腹血糖和餐后2小时血糖，餐后2小时血糖能反映机体对葡萄糖的耐受情况。