病毒性结膜炎主要通过抗病毒药物治疗，常用的有阿昔洛韦等，一般经过规范治疗，多数患者在1~2周内可逐渐恢复。
药物治疗选择
抗病毒药物： 阿昔洛韦是常用的抗病毒药物，它能抑制病毒DNA的合成，从而发挥抗病毒作用，可有效缓解病毒性结膜炎的症状。更昔洛韦眼用凝胶也可用于病毒性结膜炎的治疗，对病毒的复制有抑制作用。
一般护理措施
眼部清洁： 患者可以用生理盐水清洗眼部，每天可清洗2~3次，这样能清除眼部分泌物，保持眼部清洁，减轻不适症状。不过清洗时要注意动作轻柔，避免损伤眼部。避免揉眼： 病毒性结膜炎患者要尽量避免用手揉眼睛，因为用手揉眼可能会导致病毒进一步扩散，加重炎症反应，还可能造成眼部继发感染。
特殊人群注意事项
儿童患者： 儿童患病毒性结膜炎时，用药需格外谨慎。一般不建议低龄儿童自行使用成人的抗病毒眼药水，应在医生指导下选择适合儿童的剂型，如儿童专用的眼药水等。同时要密切观察儿童用药后的反应，如有异常及时就医。孕妇患者： 孕妇患病毒性结膜炎时，用药要非常小心。很多抗病毒药物可能会对胎儿产生影响，所以孕妇需要在医生的评估下选择相对安全的治疗方法，可能会优先考虑局部的物理清洁等非药物方式来缓解症状，待生产后再进行规范的药物治疗。