抑郁症的治疗药物有多种，常用的如选择性5-羟色胺再摄取抑制剂（SSRI），这类药物约有60%~70%的抑郁症患者使用后能改善症状。
选择性5-羟色胺再摄取抑制剂
氟西汀： 属于SSRI类药物，能选择性抑制突触前膜对5-羟色胺的再摄取，提高突触间隙5-羟色胺浓度，发挥抗抑郁作用。一般需连续服用数周才能起效。帕罗西汀： 同样是SSRI，可有效缓解抑郁症的情绪低落、兴趣减退等症状，对伴有焦虑的抑郁症也有较好疗效，但可能会引起胃肠道不适等副作用。
5-羟色胺和去甲肾上腺素再摄取抑制剂（SNRI）
文拉法辛： 能同时抑制5-羟色胺和去甲肾上腺素的再摄取，起效相对较快，对多种类型的抑郁症都有一定疗效，但初始用药时可能会出现血压轻度升高的情况，需监测血压。度洛西汀： 也是SNRI类药物，除了治疗抑郁症，还可用于缓解伴随的焦虑症状，不过肝功能不全者需谨慎使用。
去甲肾上腺素和特异性5-羟色胺能抗抑郁药（NaSSA）
米氮平： 通过阻断中枢突触前α₂受体，增加去甲肾上腺素和5-羟色胺的释放来发挥抗抑郁作用，它还能改善睡眠，对伴有睡眠障碍的抑郁症患者较为适用，但可能会引起体重增加等问题。
三环类抗抑郁药
阿米替林： 属于三环类，曾是常用的抗抑郁药，但由于其抗胆碱能副作用较多，如口干、便秘、视物模糊等，现在临床应用相对减少，一般用于其他药物治疗效果不佳的情况。丙米嗪： 也是三环类药物，能提高突触间隙去甲肾上腺素和5-羟色胺的浓度，不过其副作用如心血管方面的影响也需要关注，老年人使用时更要谨慎。