儿童抽动症的病因目前尚未完全明确，可能与遗传因素、神经生物学因素以及心理社会因素等有关。有研究表明，约50% - 60%的抽动症儿童有家族遗传史，若一级亲属中有患抽动症的情况，儿童发病风险会增加。
遗传因素方面
基因遗传： 多项研究发现，抽动症具有一定的遗传倾向。如果家族中有直系亲属患有抽动症，那么儿童患抽动症的概率比普通儿童要高。例如，有家族遗传背景的儿童，其基因中可能存在与抽动症相关的突变位点，这些位点会增加患病风险。家族聚集性： 在有抽动症患者的家族中，往往会出现多个家庭成员患病的情况，这进一步支持了遗传因素在儿童抽动症发病中的重要作用。
神经生物学因素方面
神经递质失衡： 大脑中的神经递质如多巴胺、去甲肾上腺素、5 - 羟色胺等的失衡可能与儿童抽动症有关。比如，多巴胺功能亢进可能会导致抽动症的发生，当大脑内多巴胺受体超敏或多巴胺代谢异常时，就可能引发肌肉不自主的抽动等症状。大脑结构异常： 部分患有抽动症的儿童在大脑影像学检查中发现，大脑某些区域的结构存在异常，像基底节等部位的结构和功能可能与正常儿童有所不同，这些结构上的改变可能影响神经信号的传递，从而导致抽动症的出现。
心理社会因素方面
心理压力过大： 长期处于较大心理压力下的儿童容易患抽动症。例如，儿童在学校面临学习成绩不理想、与同学关系紧张等情况，或者家庭中存在父母关系不和睦、家庭环境突然发生重大变化（如父母离异、亲人离世等），这些心理压力都可能成为诱发儿童抽动症的因素。不良生活事件影响： 一些突发的不良生活事件也可能刺激儿童发病。比如，儿童经历了严重的惊吓、遭受了意外伤害等，这些强烈的刺激可能会通过影响儿童的神经内分泌等功能，进而引发抽动症。