百多邦软膏通用名为莫匹罗星软膏，一般来说，正确使用时副作用较少，但少数人可能出现一些情况。
局部皮肤反应方面
局部刺激： 少数人使用后可能在用药部位出现轻微的烧灼感，一般比较短暂，不会对正常生活造成太大影响。比如有患者在短期使用莫匹罗星软膏涂抹小面积皮肤感染时，用药部位会有短暂的轻微刺痛感，但很快就消失了。过敏反应： 虽然发生率较低，但也有个别人会对莫匹罗星软膏过敏，表现为用药部位出现瘙痒、红肿、皮疹等情况。一旦出现这些过敏表现，应立即停止使用该药物，并清洗掉局部的药物。
与其他药物相互作用方面
一般药物相互作用： 目前虽尚未发现莫匹罗星软膏与其他常用药物有明显的相互作用，但如果正在使用其他药物，在使用莫匹罗星软膏前最好咨询医生或药师。例如正在使用一些外用制剂的患者，同时使用莫匹罗星软膏时，需要考虑药物之间可能存在的潜在相互影响。特殊人群的相互作用： 对于孕妇和哺乳期女性，目前关于莫匹罗星软膏的安全性研究相对有限，但从药物代谢角度来看，一般局部外用时进入全身血液循环的量极少，对胎儿或婴儿的影响较小，但仍建议在医生指导下谨慎使用，以确保安全。
特殊人群使用注意事项方面
儿童使用： 2岁以下儿童使用莫匹罗星软膏需要格外谨慎，应在医生的指导下使用。因为儿童的皮肤较为娇嫩，对药物的耐受和反应可能与成人不同，虽然局部外用相对全身吸收少，但仍需密切观察儿童用药后的反应。老年人使用： 老年人如果皮肤有感染需要使用莫匹罗星软膏，一般来说局部外用通常是安全的，但老年人可能存在皮肤屏障功能减退等情况，在使用过程中要注意观察皮肤的反应，如出现异常应及时就医。