三岁宝宝牙齿腐烂掉了，可通过以下方式处理：
一、保持口腔卫生：宝宝牙齿腐烂多因不恰当饮食，如过多食用蛋糕、奶糖等甜食，或是家长未重视宝宝口腔卫生、未按时刷牙所致。对此，家长应做到早晚为宝宝刷牙，这能减少口腔内细菌繁殖，避免牙齿进一步被腐蚀。饭后也需及时漱口，以防食物残留引发炎症，平时要控制宝宝甜食的摄入量。
二、药物治疗：乳牙腐烂可能引发牙龈炎症或牙周炎症，出现牙龈红肿、发炎等情况。此时可遵医嘱让宝宝服用消炎类药物，如头孢克洛颗粒、阿莫西林颗粒等进行消炎处理。
三、涂氟治疗：宝宝牙齿腐烂掉了，这表明家长在宝宝口腔卫生工作方面做得不到位，导致龋坏发生。可以给宝宝进行涂氟治疗，其能起到保护牙齿、预防龋坏的作用，防止其他牙齿也出现腐烂掉落的情况。若宝宝牙齿腐烂程度不严重，还可进行牙齿修补，以恢复牙齿外观和咀嚼功能。
总之，当三岁宝宝牙齿出现腐烂掉了的情况后，要采取多种措施来处理，包括保持良好的口腔卫生、合理使用药物以及进行涂氟或牙齿修补等，以维护宝宝的口腔健康。