龟头上有小水泡可能由非感染性原因、生殖器疱疹、龟头炎等引起，可在医生指导下用药治疗。
一、非感染性原因：
1.性生活粗暴、用力摩擦以及局部清洁不足等均可能导致龟头上出现小水泡。这种情况下，通常疼痛不明显，且有可能自行缓解。
二、生殖器疱疹：
1.这是由单纯疱疹病毒引起的一种性传播疾病。其症状表现为龟头上、阴部或肛周出现小水泡，同时可能伴有发烧、疼痛、头痛、疲劳等。可在医生指导下使用如下药物进行治疗：
(1)盐酸伐昔洛韦片；
(2)阿昔洛韦片；
(3)泛昔洛韦片。
三、龟头炎：
1.通常也会引发龟头上出现小水泡，甚至还会有糜烂、渗出和出血现象。可在医生指导下使用如下药物进行治疗：
(1)盐酸左氧氟沙星胶囊；
(2)氟康唑胶囊；
(3)伊曲康唑胶囊。
建议治疗期间，每日要勤清洗生殖器，勤换内裤，避免剧烈运动，注意多休息，不要长时间熬夜，防止过度劳累。
总结概况提示：龟头上出现小水泡的原因多样，包括非感染性因素以及生殖器疱疹、龟头炎等疾病原因，要根据具体情况进行诊断和治疗，同时在治疗期间要注意个人卫生和生活习惯。