全身疼痛可能由多种原因引起，比如健康人群在剧烈运动后，可能会有全身酸痛感，一般休息1~2天可缓解。
疾病因素导致的全身疼痛
感染性疾病：
流感病毒感染：感染流感病毒后，患者通常会出现高热、全身肌肉酸痛、头痛、乏力等症状，体温可高达39~40℃，还可能伴有鼻塞、流涕、咳嗽等呼吸道症状。一般病程在1周左右，但全身疼痛等不适可能会持续数天。细菌感染引发的脓毒血症：严重的细菌感染可能引发脓毒血症，患者会出现全身多处疼痛，同时伴有高热、寒战、精神萎靡等表现，病情严重时可能危及生命。
风湿免疫性疾病：
类风湿关节炎：多发生在双手、双腕等小关节，但也可能累及全身关节，导致全身关节疼痛、肿胀、僵硬，尤其在早晨起床时症状较为明显，这种晨僵现象一般持续30分钟以上，病情进展可能会导致关节畸形。系统性红斑狼疮：患者会出现全身多部位疼痛，如关节痛、肌肉痛等，还可能伴有面部红斑、口腔溃疡、脱发、蛋白尿等症状，病情容易反复发作。
肿瘤性疾病：
骨转移瘤：某些恶性肿瘤晚期可能发生骨转移，如肺癌、乳腺癌、前列腺癌等转移至骨骼时，会引起全身骨骼疼痛，疼痛程度较为剧烈，且可能伴有病理性骨折等情况。血液系统肿瘤：白血病等血液系统肿瘤患者，可能出现全身骨骼疼痛，尤其是胸骨压痛较为常见，同时还可能伴有贫血、发热、出血等表现。
非疾病因素导致的全身疼痛
过度劳累：
长时间进行重体力劳动、剧烈运动或连续加班熬夜等，身体会产生大量乳酸，当乳酸在肌肉内堆积时，就会引起全身肌肉酸痛，一般经过休息、按摩等处理后可逐渐缓解。
环境因素：
寒冷潮湿环境：长期处于寒冷潮湿的环境中，人体血管收缩，血液循环不畅，容易导致全身关节、肌肉疼痛，尤其对于一些有关节炎病史的人来说，症状可能会加重。比如在寒冷的冬天，长期在室外工作的人更容易出现全身疼痛不适。