胃肠炎常用的药物有止泻药、止吐药、调节肠道菌群药等。比如蒙脱石散是常用的止泻药，能吸附肠道内的病菌和毒素，起到止泻作用。
止泻药物：
蒙脱石散： 它可以吸附肠道内的病原体和毒素，对各种原因引起的腹泻有一定的缓解作用。一般来说，成人每次服用1袋（3克），儿童需按年龄减量服用。黄连素： 具有一定的抗菌作用，对于细菌感染引起的胃肠炎导致的腹泻有一定疗效，成人常用量一次0.1 - 0.3克，一日3次。
止吐药物：
甲氧氯普胺： 能促进胃肠蠕动，缓解呕吐症状。成人常用量肌内注射一次10 - 20毫克，不过孕妇慎用。昂丹司琼： 主要用于缓解放疗、化疗及手术引起的恶心、呕吐，对于胃肠炎因呕吐严重的情况也可使用，一般成人用量为一次8毫克，一日2 - 3次。
调节肠道菌群药物：
双歧杆菌四联活菌片： 可以补充肠道有益菌，调节肠道菌群平衡，改善胃肠炎引起的肠道功能紊乱。成人一次3片，一日3次，温开水送服。地衣芽孢杆菌活菌胶囊： 能够促进肠道有益菌生长，抑制有害菌繁殖，对胃肠炎有一定的辅助治疗作用，成人一次2粒，一日3次。
抗感染药物：
如果是细菌感染引起的胃肠炎，可能需要使用抗感染药物。比如诺氟沙星，适用于敏感菌所致的肠道感染，但18岁以下的未成年人禁用，因为可能会影响软骨发育。如果是病毒感染引起的胃肠炎，一般不需要使用抗感染药物，主要是对症治疗。