女性生殖器先天性畸形的治疗需根据具体畸形类型等因素来定。比如处女膜闭锁多在青春期发现，表现为逐渐加重的周期性下腹痛，治疗主要是手术切开处女膜，一般手术相对简单，术后恢复较好。
处女膜闭锁的治疗
手术切开： 一旦确诊处女膜闭锁，应尽早行处女膜切开术。这是一种简单的小手术，在局部麻醉下即可进行，切开后积血流出，症状迅速缓解。
阴道闭锁的治疗
部分阴道闭锁： 若为部分阴道闭锁，可根据阴道闭锁的程度选择手术。一般是在闭锁部位做X形切开，然后将切口边缘与周围组织缝合，形成人工阴道，以恢复正常的性生活及月经排出等功能。完全阴道闭锁： 完全阴道闭锁则需要更复杂的手术，可能需要借助肠道等组织来构建人工阴道，手术难度相对较大，但通过手术也能改善患者的生活质量。
先天性无阴道的治疗
非手术治疗： 对于先天性无阴道且有性生活需求的患者，可先采用模具顶压法。即使用阴道模型，每日进行顶压，通过长期的顶压使阴道逐渐延伸，一般需要持续几个月的时间来达到一定的阴道深度，以满足性生活需要。手术治疗： 手术治疗方面，可采用乙状结肠代阴道术等。通过手术利用自身的肠道组织来构建阴道，手术成功后能在一定程度上恢复阴道的功能，但术后需要注意护理，防止感染等并发症的发生。同时，患者术后还需要定期进行复查，以确保阴道的状态良好。