胆汁反流性胃炎伴胃窦糜烂的治疗通常采用药物治疗，以下是一些常用的药物：
1.胃黏膜保护剂：如硫糖铝、枸橼酸铋钾等，可在胃黏膜表面形成一层保护膜，减轻胆汁对胃黏膜的损伤。
2.促胃肠动力药：如多潘立酮、莫沙必利等，可增强胃排空，减少胆汁反流。
3.胃酸抑制剂：如奥美拉唑、兰索拉唑等，可抑制胃酸分泌，缓解胃酸对胃黏膜的刺激。
4.抗抑郁药：如果患者伴有明显的焦虑、抑郁等情绪问题，可能需要使用抗抑郁药，如氟西汀、帕罗西汀等。
除了药物治疗，患者还需要注意调整饮食习惯和生活方式，如避免高脂肪、高糖、辛辣等刺激性食物，戒烟戒酒，避免熬夜等。此外，一些中药也可能对胆汁反流性胃炎伴胃窦糜烂有一定的治疗作用，但需要在医生的指导下使用。
需要注意的是，每个人的病情和体质不同，对药物的反应也可能不同。因此，在选择药物时，应根据个人情况在医生的指导下进行。同时，患者应遵医嘱按时服药，并定期复查，以便及时调整治疗方案。如果症状严重或持续不缓解，应及时就医，以便进行进一步的检查和治疗。