囊肿性痤疮是比较严重的痤疮类型，治疗方法多样。一般来说，可通过外用药物、口服药物以及物理治疗等方式来改善。
外用药物治疗
维A酸类药物： 像阿达帕林凝胶就属于此类药物，它能调节毛囊口角化，改善毛囊堵塞情况，从而缓解囊肿性痤疮。但使用时要注意，可能会有局部刺激反应，如皮肤发红、脱屑等，而且在孕期是禁止使用的。过氧苯甲酰： 具有杀灭痤疮丙酸杆菌、抗炎的作用。可以外用涂抹在患处，不过可能会使皮肤干燥、脱屑，所以皮肤敏感者要谨慎使用。
口服药物治疗
抗生素： 比如四环素类的米诺环素，能抑制痤疮丙酸杆菌的生长繁殖，减轻炎症反应。但长期使用可能会导致耐药性，而且孕妇、8岁以下儿童要避免使用。异维A酸： 对于严重的囊肿性痤疮有较好的疗效，它可以减少皮脂腺分泌、调节毛囊皮脂腺导管角化。不过此药副作用较多，可能会引起皮肤干燥、口唇干裂，还可能对肝脏有一定影响，且育龄期男女服药期间及停药后3个月内需严格避孕。
物理治疗
光动力治疗： 是将光敏剂涂抹在皮肤上，经光照射后产生单线态氧，破坏痤疮丙酸杆菌及细胞组织，减轻炎症。一般需要多次治疗，每次治疗间隔一定时间，治疗后要注意防晒。红蓝光治疗： 蓝光可以杀灭痤疮丙酸杆菌，红光能修复皮肤组织、减轻炎症。通常每周进行2 - 3次治疗，经过几次治疗后能看到囊肿性痤疮有所改善。
日常护理方面
皮肤清洁： 要选择合适的洁面产品，每天清洁皮肤，但不要过度清洁，以免破坏皮肤屏障。一般早晚各清洁一次即可。饮食调整： 要减少高糖、高脂食物的摄入，如糖果、油炸食品等，多吃蔬菜水果。同时要保持规律的作息，避免熬夜，因为熬夜可能会加重囊肿性痤疮的症状。