便秘肛门有肉凸出来可能是内痔、外痔、混合痔等肛肠疾病的症状，也可能是其他疾病的表现。以下是一些可能的治疗方法：
1.调整饮食：增加膳食纤维的摄入，多饮水，避免久坐久立，适量运动，有助于改善便秘。
2.药物治疗：可以使用开塞露、甘油栓等润滑剂，或口服乳果糖、聚乙二醇等泻药，以软化粪便、促进排便。还可以使用痔疮膏、痔疮栓等药物，缓解肛门疼痛、出血等症状。
3.坐浴：用温水或中药坐浴，可改善局部血液循环，减轻肛门括约肌痉挛，缓解疼痛。
4.手术治疗：如果保守治疗无效，或症状严重影响生活质量，可能需要手术治疗。手术方法包括内痔结扎术、外痔切除术、混合痔外剥内扎术等。
5.其他治疗：如红外线凝固疗法、冷冻疗法等，适用于内痔或外痔的治疗。
需要注意的是，以上治疗方法应在医生的指导下进行，根据具体病情选择合适的治疗方案。同时，便秘肛门有肉凸出来也可能是某些严重疾病的症状，如直肠癌、直肠息肉等，因此，如果症状持续不缓解或伴有其他不适，应及时就医，进行详细的检查，以明确诊断，并采取相应的治疗措施。