乙肝小三阳伴有脂肪肝的患者通常需要进行抗病毒治疗，可选用的药物包括恩替卡韦、替诺福韦、替比夫定、阿德福韦酯、拉米夫定等，且抗病毒治疗的疗程一般要达到3至5年以上。若同时合并有转氨酶升高的情况，则可以使用护肝降酶类药物进行治疗，比如异甘草酸镁、复方甘草酸苷、甘草酸二铵、还原型谷胱甘肽、双环醇片等。在治疗过程中，患者需要戒酒，饮食以清淡为主，鼓励多吃新鲜的蔬菜水果，避免食用高脂、高糖、高热量食物。同时，患者还需要适当运动。以下是具体阐述：
一、抗病毒治疗
1.恩替卡韦：是一种有效的抗病毒药物。
2.替诺福韦：在乙肝治疗中发挥重要作用。
3.替比夫定：可用于乙肝小三阳伴有脂肪肝患者的抗病毒。
4.阿德福韦酯：对病毒有抑制效果。
5.拉米夫定：是常用的抗病毒药之一。
二、护肝降酶类药物
1.异甘草酸镁：能起到护肝降酶的作用。
2.复方甘草酸苷：帮助改善肝脏功能。
3.甘草酸二铵：可降低转氨酶。
4.还原型谷胱甘肽：对肝脏有保护功效。
5.双环醇片：适用于转氨酶升高时的治疗。
总之，对于乙肝小三阳伴有脂肪肝的患者，要根据具体情况选择合适的药物进行治疗，同时注意生活方式的调整，包括戒酒、清淡饮食、多吃新鲜果蔬、避免高脂高糖高热量食物、适当运动等，以促进病情的改善和恢复。