宝宝睡觉时咳嗽的原因包括过敏、鼻窦炎、支气管炎、反流性食管炎等。具体如下：
一、过敏：宝宝若是易过敏体质，在夜间睡眠时接触到过敏原，比如床上用品存在螨虫、灰尘等，引发过敏反应，就会出现睡觉时咳嗽现象。
二、鼻窦炎：鼻窦有炎症时，会使鼻内分泌物增多，晚上睡觉时平躺会导致分泌物倒流至咽喉部，从而产生刺激性咳嗽，而白天站立时鼻腔内的分泌物不会倒流刺激。
三、支气管炎：这是由多种因素引起的气管、支气管黏膜及周围组织的炎症，会有鼻塞、鼻涕、咽痛、咳嗽等表现。
四、反流性食管炎：由于孩子的贲门括约肌发育不完善，晚上睡觉时胃内物质反流到食管，刺激食管进而造成咳嗽症状。
宝宝睡觉时咳嗽的注意事项：
1.建议勤晾晒床上用品，防止螨虫滋生，同时要保持室内清洁，远离过敏原。
2.如果还有其他身体不适或长时间咳嗽不愈，应及时前往医院，积极进行治疗。
总结：宝宝睡觉时咳嗽原因多样，要注意针对具体情况进行分析和处理，同时要做好相关注意事项。