果酸换肤可能带来多种危害，如皮肤敏感、色素沉着、感染等。
皮肤敏感
果酸换肤会去除皮肤表面的角质层，使皮肤屏障功能暂时减弱，容易出现皮肤敏感状况，表现为皮肤泛红、瘙痒等，尤其对于皮肤较为脆弱的人群，如干性皮肤者，这种敏感情况可能更易发生。
色素沉着
若果酸换肤后未做好防晒措施，紫外线刺激可能导致皮肤色素沉着，使皮肤颜色变深，影响美观。特别是肤色较深的人群，发生色素沉着的风险相对更高。
感染风险
果酸换肤会在皮肤表面造成微小创口，若术后护理不当，细菌等病原体容易侵入创口引发感染，出现红肿、疼痛加剧甚至化脓等症状。
脱皮过度
果酸换肤后可能出现脱皮现象，但如果果酸浓度过高或操作不当，可能导致脱皮过度，严重影响皮肤的正常状态和外观，给皮肤修复带来困难。特殊人群需格外注意，例如敏感肌肤人群进行果酸换肤需谨慎，因其本身皮肤耐受性差，更易出现上述危害；孕妇由于身体处于特殊生理状态，皮肤状况不稳定，果酸换肤可能对其和胎儿产生不良影响，应避免进行果酸换肤。